Ένα από τα στοιχεία του Ευρωπαϊκού Μηχανισμού Πολιτικής Προστασίας είναι το εκπαιδευτικό πρόγραμμα που απευθύνεται σε προσωπικό των φορέων που λαμβάνει μέρος στις επεμβάσεις (πχ. αρχηγούς ή μέλη ομάδων επέμβασης, εμπειρογνώμονες) ή ασχολείται με το αντικείμενο της παροχής και λήψης βοήθειας μέσω του Μηχανισμού. Σύντομα αναμένεται να ξεκινήσει ειδική εκπαίδευση για τις Μονάδες Πολιτικής Προστασίας.

Το εκπαιδευτικό πρόγραμμα περιλαμβάνει κυρίως τους εξής κύκλους μαθημάτων:

•                Εισαγωγικό σεμινάριο - Induction Course

•                Σεμινάριο Επιχειρησιακής Διαχείρισης - Operational Management Course

•                Σεμινάριο Συντονισμού Υψηλής Βαθμίδας - High Level Coordination course.

Από το 2006 προστέθηκαν άλλοι τρεις κύκλοι σεμιναρίων ως εξής:

•                Συντονισμού Υψηλής Βαθμίδας, επαναληπτικά σεμινάρια (High level Coordination Refresher courses)

•                Σεμινάρια Διαχείρισης Προσωπικού (Staff Management Courses)

•                Σεμινάρια Αποτίμησης Αποστολών (Assessment Mission Courses)

Από το 2007 προστέθηκαν τα εξής σεμινάρια:

•               Μέσα Ενημέρωσης και Στρατηγική Ασφάλειας - Media and Security Strategy

•               Σεμινάριο Επιχειρησιακής Διαχείρισης, επαναληπτικά σεμινάρια - Operational Management Refresher Courses

Έχουν ήδη ολοκληρωθεί 5 κύκλοι εκπαιδεύσεων και έχει ξεκινήσει ο 6^ος κύκλος. Κάθε χώρα συμμετέχει στο εκπαιδευτικό πρόγραμμα με αριθμό μαθητών αναλογικά με το πλήθος των ομάδων και το πλήθος των εμπειρογνωμόνων που εν δυνάμει μπορεί να συνεισφέρει η χώρα αυτή σε περιπτώσεις εκτάκτων αναγκών μέσω του Μηχανισμού.