Οι προτάσεις αξιολογούνται από την Ε. Επιτροπή με την εξής σειρά κριτηρίων:

•           Εκτιμάται η κανονικότητα των προτάσεων -  τυπικά κριτήρια επιλεξιμότητας.

•           Εκτιμάται το αν ισχύουν ή όχι κριτήρια αποκλεισμού - κριτήρια αποκλεισμού.

•           Εκτιμάται η οικονομική και τεχνική δυνατότητα του αιτούντος - κριτήρια επιλογής.

•           Αξιολογείται η γενικότερη σχετικότητα των προτάσεων προς τους αντικειμενικούς στόχους που θέτει η προκήρυξη καθώς και η ποιότητα τους - κριτήρια απονομής.

Μόνον οι προτάσεις που πληρούν τα κριτήρια επιλεξιμότητας, αποκλεισμού και επιλογής θεωρούνται αποδεκτές για περαιτέρω αξιολόγηση. Κατά το στάδιο της απονομής, η Επιτροπή αξιολογεί τη συνάφεια της πρότασης και την ποιότητά της. Μια πρόταση πρέπει να επιδεικνύει σαφή αντίληψη των στόχων της πρόσκλησης για υποβολή και των θεματικών προτεραιοτήτων της.